Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmod1P49813 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmod1P49813 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms