Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
PtgfrP43117 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms