Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms