Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PpargP37238 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PpargP37238 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
PpargP37238 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms