Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprkP35822 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprkP35822 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprkP35822 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprkP35822 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprkP35822 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprkP35822 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprkP35822 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprkP35822 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms