Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd22P35329 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd22P35329 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms