Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rab20P35295 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rab20P35295 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab20P35295 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rab20P35295 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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