Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VtnP29788 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
VtnP29788 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VtnP29788 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VtnP29788 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms