Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HexaP29416 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HexaP29416 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
HexaP29416 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
HexaP29416 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HexaP29416 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HexaP29416 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HexaP29416 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HexaP29416 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HexaP29416 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HexaP29416 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HexaP29416 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HexaP29416 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HexaP29416 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HexaP29416 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms