Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprmP28828 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprmP28828 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprmP28828 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprmP28828 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
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