Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa3P28310 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms