Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gjc1P28229 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gjc1P28229 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms