Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Vav1P27870 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Vav1P27870 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vav1P27870 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vav1P27870 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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