Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CftrP26361 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CftrP26361 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CftrP26361 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CftrP26361 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CftrP26361 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CftrP26361 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CftrP26361 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CftrP26361 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CftrP26361 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CftrP26361 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CftrP26361 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CftrP26361 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CftrP26361 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CftrP26361 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CftrP26361 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CftrP26361 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CftrP26361 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CftrP26361 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CftrP26361 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CftrP26361 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CftrP26361 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CftrP26361 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CftrP26361 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CftrP26361 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CftrP26361 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CftrP26361 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CftrP26361 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CftrP26361 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CftrP26361 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CftrP26361 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CftrP26361 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CftrP26361 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CftrP26361 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CftrP26361 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CftrP26361 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CftrP26361 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CftrP26361 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CftrP26361 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CftrP26361 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CftrP26361 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CftrP26361 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CftrP26361 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CftrP26361 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CftrP26361 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CftrP26361 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CftrP26361 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CftrP26361 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CftrP26361 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CftrP26361 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CftrP26361 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CftrP26361 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CftrP26361 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CftrP26361 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CftrP26361 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CftrP26361 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CftrP26361 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CftrP26361 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CftrP26361 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CftrP26361 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CftrP26361 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CftrP26361 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CftrP26361 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CftrP26361 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CftrP26361 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CftrP26361 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CftrP26361 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CftrP26361 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CftrP26361 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CftrP26361 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CftrP26361 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CftrP26361 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CftrP26361 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CftrP26361 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CftrP26361 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CftrP26361 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CftrP26361 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CftrP26361 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CftrP26361 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CftrP26361 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CftrP26361 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CftrP26361 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CftrP26361 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CftrP26361 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CftrP26361 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CftrP26361 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CftrP26361 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CftrP26361 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CftrP26361 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CftrP26361 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CftrP26361 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CftrP26361 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CftrP26361 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CftrP26361 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CftrP26361 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CftrP26361 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CftrP26361 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CftrP26361 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CftrP26361 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CftrP26361 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms