Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChgaP26339 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChgaP26339 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChgaP26339 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ChgaP26339 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ChgaP26339 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChgaP26339 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChgaP26339 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
ChgaP26339 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms