Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Ggta1P23336 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ggta1P23336 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms