Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Eif3aP23116 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms