Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RarbP22605 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RarbP22605 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RarbP22605 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RarbP22605 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RarbP22605 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RarbP22605 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RarbP22605 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RarbP22605 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RarbP22605 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RarbP22605 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RarbP22605 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RarbP22605 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms