Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Fcer1aP20489 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Fcer1aP20489 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Fcer1aP20489 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Fcer1aP20489 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Fcer1aP20489 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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