Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PrkcaP20444 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms