Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NelfeP19426 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NelfeP19426 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms