Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RargP18911 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RargP18911 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RargP18911 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RargP18911 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RargP18911 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RargP18911 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RargP18911 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RargP18911 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RargP18911 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RargP18911 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RargP18911 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RargP18911 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RargP18911 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RargP18911 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RargP18911 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RargP18911 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RargP18911 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RargP18911 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RargP18911 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RargP18911 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RargP18911 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RargP18911 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RargP18911 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RargP18911 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RargP18911 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RargP18911 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms