Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxb1P17919 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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