Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcna1P16388 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcna1P16388 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms