Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Hoxd4P10628 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms