Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
P10404 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
P10404 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
P10404 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
P10404 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
P10404 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
P10404 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
P10404 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
P10404 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
P10404 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
P10404 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
P10404 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
P10404 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
P10404 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
P10404 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
P10404 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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