Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxb4P10284 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxb4P10284 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms