Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
UbbP0CG49 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms