Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Spta1P08032 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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