Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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H2-Eb1P04230 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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H2-Eb1P04230 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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H2-Eb1P04230 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
H2-Eb1P04230 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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H2-Eb1P04230 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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H2-Eb1P04230 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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H2-Eb1P04230 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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H2-Eb1P04230 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
H2-Eb1P04230 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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