Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04214 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P04214 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04214 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04214 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04214 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04214 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04214 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04214 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04214 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04214 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04214 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04214 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P04214 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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P04214 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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P04214 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P04214 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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P04214 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04214 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04214 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04214 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04214 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04214 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04214 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04214 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04214 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04214 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04214 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04214 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P04214 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P04214 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P04214 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04214 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04214 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04214 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04214 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04214 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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P04214 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P04214 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P04214 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P04214 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P04214 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04214 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04214 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04214 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04214 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04214 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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P04214 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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P04214 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04214 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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P04214 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04214 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04214 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04214 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04214 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04214 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P04214 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P04214 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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