Protein–RNA interactions for Protein: P01739

T-cell receptor alpha chain V region 2B4, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01739 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01739 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P01739 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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