Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01645 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01645 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01645 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01645 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01645 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01645 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01645 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
P01645 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01645 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01645 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01645 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01645 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01645 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01645 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01645 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
P01645 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01645 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P01645 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01645 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01645 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01645 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
P01645 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01645 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01645 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01645 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01645 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01645 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01645 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01645 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01645 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01645 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01645 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01645 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
P01645 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P01645 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P01645 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P01645 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms