Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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BckdkO55028 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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BckdkO55028 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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BckdkO55028 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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