Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SlkO54988 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SlkO54988 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SlkO54988 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SlkO54988 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SlkO54988 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SlkO54988 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SlkO54988 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SlkO54988 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SlkO54988 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SlkO54988 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms