Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn5O54942 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn5O54942 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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