Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CrxO54751 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
CrxO54751 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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CrxO54751 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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CrxO54751 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CrxO54751 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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