Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
FxnO35943 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
FxnO35943 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FxnO35943 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms