Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ebi3O35228 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ebi3O35228 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms