Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pitx3O35160 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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