Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Eftud2O08810 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms