Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sec22bO08547 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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