Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MsmbO08540 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
MsmbO08540 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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