Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm20939L7N243 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms