Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm2056J3QQ02 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm2056J3QQ02 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms