Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm8298J3QPI0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm8298J3QPI0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8298J3QPI0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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