Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5849J3QPE5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms