Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20918J3QN17 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms