Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11236J3QMS7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11236J3QMS7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms