Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tmem200cJ3QK46 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Tmem200cJ3QK46 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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